O campo da biologia molecular estuda macromoléculas e os mecanismos macromoleculares encontrados em seres vivos, como a natureza molecular do gene e seus mecanismos de replicação de genes, mutação e expressão. Dada a importância fundamental destes mecanismos macromoleculares ao longo da história da biologia molecular, um foco filosófico no conceito de um mecanismo gera a imagem mais clara da história, conceitos e estudos de caso da biologia molecular utilizados por filósofos da ciência.
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